More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0313 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  100 
 
 		 342 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 		 330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  38.86 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  31.03 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  37.41 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  34.88 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  30.51 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 455 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  30.2 
 
 		 283 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5891  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 		 336 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  31.39 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 722 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 		 841 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  30.29 
 
 		 838 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 		 836 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 290 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 1523 aa  99.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 346 aa  96.3  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 1523 aa  95.9  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 		 616 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 314 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 		 334 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  27.36 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 703 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 313 aa  89.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 300 aa  89.4  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  26.93 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 1267 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 		 994 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  21.71 
 
 		 297 aa  86.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 841 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 1267 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 1739 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  27.57 
 
 		 860 aa  82.8  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  29.66 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 1435 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25.86 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02870  hypothetical protein  26.77 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 824 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  20.39 
 
 		 754 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 902 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 		 822 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  23.7 
 
 		 970 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  31.4 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>