More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0792 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
376 aa  775    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
358 aa  225  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
841 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
318 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  30.68 
 
 
838 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
346 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
321 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
341 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
337 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
355 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
836 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.32 
 
 
322 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
320 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 
334 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 
328 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
312 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
359 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
325 aa  97.8  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
841 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
345 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  26.57 
 
 
358 aa  97.1  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
342 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  27.08 
 
 
320 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  28.97 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
298 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  27.59 
 
 
330 aa  94  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
353 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
401 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
304 aa  93.2  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
330 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
312 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  27.35 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
822 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
340 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
335 aa  90.1  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.69 
 
 
355 aa  89.7  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
306 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  27.08 
 
 
336 aa  89  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.88 
 
 
379 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  27.02 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
366 aa  86.7  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
318 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  28.32 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  25.61 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  28.15 
 
 
907 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
318 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
303 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  24.8 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  24.8 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
705 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
1340 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  23.2 
 
 
652 aa  80.5  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
616 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
1077 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
336 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3221  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>