More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3181 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
345 aa  668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  88.37 
 
 
346 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
822 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
318 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  27.79 
 
 
348 aa  109  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  32.17 
 
 
838 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25.53 
 
 
358 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
343 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
841 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
328 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
355 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  28.13 
 
 
350 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
410 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
358 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
336 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
528 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
337 aa  99.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  23.17 
 
 
339 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  25.78 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 
366 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  24.51 
 
 
339 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
334 aa  96.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
836 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
341 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
332 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  23.36 
 
 
320 aa  93.2  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
477 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  23.43 
 
 
313 aa  89.7  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  37.83 
 
 
513 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2402  hypothetical protein  30.89 
 
 
262 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
303 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
401 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
1267 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.29 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
841 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  28.44 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
430 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
324 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  25.39 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  22.32 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
748 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.61 
 
 
2401 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.66 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 
619 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
1267 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  34.27 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
1435 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 
1340 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  23.62 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  35.19 
 
 
292 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  26.09 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  29.83 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  22.19 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  18.61 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 
1120 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 
487 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  34.97 
 
 
544 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
470 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>