More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2705 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 334 aa  691    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  36.25 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  36.39 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  31.31 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  28.1 
 
 		 342 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  31.48 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  33.06 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  30.71 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  28.18 
 
 		 283 aa  106  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5891  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  28.75 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 		 722 aa  99.4  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 286 aa  97.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 		 279 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  26.01 
 
 		 838 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 1267 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 310 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 360 aa  92.8  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 340 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 		 455 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  26.77 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 340 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 489 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 822 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 841 aa  89  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.39 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 401 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 		 616 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 		 1267 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  23.96 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 340 aa  86.3  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28.2 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 624 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 841 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  29.46 
 
 		 700 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  28.27 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.2 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 679 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>