More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4928 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
513 aa  948    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  49.36 
 
 
470 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  49.36 
 
 
470 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  49.36 
 
 
470 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  48.62 
 
 
470 aa  359  5e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  47.98 
 
 
470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  46.4 
 
 
470 aa  329  7e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3773  glycosyl transferase family 2  45.47 
 
 
484 aa  302  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 
487 aa  223  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2359  glycosyl transferase family 2  41.72 
 
 
487 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000227961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 
477 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0770  glycosyl transferase family 2  39.96 
 
 
505 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  28.61 
 
 
528 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
753 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  34.41 
 
 
792 aa  126  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
924 aa  94.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
321 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
322 aa  88.6  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  37.83 
 
 
345 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
344 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0532  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
549 aa  87.4  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00736806  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
841 aa  86.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
413 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
1077 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
307 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
302 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 
337 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
325 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.31 
 
 
1120 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
353 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
1317 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.39 
 
 
337 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  28.33 
 
 
348 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
1359 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
289 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  27.36 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
822 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 
327 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.31 
 
 
309 aa  69.7  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
635 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
303 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  39.07 
 
 
292 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
313 aa  67  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
717 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  29.18 
 
 
700 aa  66.6  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
323 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  22.02 
 
 
335 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
308 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25.88 
 
 
358 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
311 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
297 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
291 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
331 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
297 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
331 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
752 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
1268 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  24.67 
 
 
345 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
328 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.65 
 
 
838 aa  64.3  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
325 aa  64.3  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5508  glycosyl transferase family 2  37.2 
 
 
283 aa  63.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164497  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  26.27 
 
 
310 aa  64.3  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  22 
 
 
994 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
328 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
296 aa  63.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
323 aa  63.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
619 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
311 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
841 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
525 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
1250 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
336 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
305 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>