More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08990 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  100 
 
 
352 aa  708    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  57.96 
 
 
337 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
346 aa  159  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
378 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
318 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 
307 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
331 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
358 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
332 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
841 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
836 aa  96.7  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
401 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  30.29 
 
 
838 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
366 aa  92  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
355 aa  89.7  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
822 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
376 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
337 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  25 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  27.64 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  23.24 
 
 
336 aa  87.8  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  26.03 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  22.4 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 
359 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
337 aa  86.3  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.65 
 
 
353 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25.07 
 
 
358 aa  85.9  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  24.25 
 
 
313 aa  85.9  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 
318 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
325 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  24.82 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  29 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
298 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 
841 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
670 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0059  glycosyl transferase family 2  22.64 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
1152 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  23.74 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  23.74 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  28.85 
 
 
1837 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
983 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.1 
 
 
2401 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
691 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  29.95 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
1077 aa  73.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
691 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0513  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.0426124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
691 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5892  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
476 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
679 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
994 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
286 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5047  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>