More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5047 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5047  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
315 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02870  hypothetical protein  37.77 
 
 
286 aa  172  9e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 
289 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
308 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
313 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
311 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
340 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
312 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
340 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
324 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
293 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 
324 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  29.3 
 
 
652 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
334 aa  95.9  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
679 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
324 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
333 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  27.51 
 
 
320 aa  93.2  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
324 aa  92.8  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
318 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
841 aa  92.4  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
329 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
311 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  25.39 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
836 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1467  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
345 aa  90.1  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0153271 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.12 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
314 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
340 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
361 aa  89.4  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
304 aa  89  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
330 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
387 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.74 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
313 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 
334 aa  87  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
274 aa  87  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
714 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
994 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.8 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  24.82 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0302  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.128733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  25.88 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  24.82 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  24.82 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
1077 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  23.62 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  26.98 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.29 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
1340 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
624 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  27.92 
 
 
860 aa  80.1  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.24 
 
 
838 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
703 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  23.81 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
303 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  27.45 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  27.45 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0513  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.0426124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
334 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  23.27 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>