More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0077 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 287 aa  580  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4485  glycosyl transferase family 2  41.49 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  41.01 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4373  glycosyl transferase family 2  41.01 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 340 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  31.64 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.34 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  30.54 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  31.9 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  25.63 
 
 		 652 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0018  glycosyl transferase  24.74 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 340 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 		 335 aa  85.5  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 841 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  34.17 
 
 		 838 aa  82.8  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  33.19 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.67 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 		 1340 aa  79.7  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 		 836 aa  79.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4212  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0566  glycosyltransferase-like  27.65 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5047  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1219  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.428258  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02870  hypothetical protein  29.15 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1249  glycosyl transferase  31.39 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 		 714 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.35 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0899  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.85 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  36.3 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  37.67 
 
 		 613 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2391  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.337746  normal  0.474802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  36.3 
 
 		 623 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  36.3 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.3 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3131  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.3 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  36.3 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.19 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 		 691 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 		 691 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 691 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>