More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3199 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
312 aa  643    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  35.88 
 
 
317 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 
320 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
298 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
322 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
290 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
401 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
303 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
970 aa  93.2  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  30.67 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
321 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
319 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
324 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
288 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
1340 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  32.42 
 
 
642 aa  83.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  26.3 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  26.72 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4212  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0018  glycosyl transferase  23.71 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5047  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  27.8 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  26.77 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
714 aa  72.8  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
1486 aa  72.4  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
656 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 
841 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  24.03 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  24.61 
 
 
836 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
994 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25.56 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
824 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  29.37 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>