More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4485 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4485  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
294 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  78.95 
 
 
290 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4373  glycosyl transferase family 2  89.46 
 
 
327 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  90.14 
 
 
327 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 
274 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  41.49 
 
 
287 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
294 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
324 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 
312 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
294 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
311 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
297 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
308 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
360 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
317 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
325 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 
310 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
296 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
296 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
296 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
307 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
308 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
305 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.46 
 
 
379 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  31.39 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 
320 aa  92.8  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
334 aa  92  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
387 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
342 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
691 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  31.13 
 
 
288 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
683 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
329 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 
317 aa  89.7  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
282 aa  89.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
324 aa  89  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
310 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
310 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
310 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  34.89 
 
 
691 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 
691 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
327 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
285 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1249  glycosyl transferase  31.78 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1219  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.428258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.16 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
785 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  28.95 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
705 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2412  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  33.98 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.76 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
624 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  24.15 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.5 
 
 
2401 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  24.15 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
679 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  31.14 
 
 
318 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  30.12 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  31.82 
 
 
1074 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>