More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4004 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 327 aa  642    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4373  glycosyl transferase family 2  97.86 
 
 		 327 aa  547  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4485  glycosyl transferase family 2  90.14 
 
 		 294 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  78.95 
 
 		 290 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  39.32 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  40.25 
 
 		 287 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.87 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  33.74 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  30.98 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 289 aa  99.4  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 291 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 387 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  30.65 
 
 		 301 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  32.77 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 683 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 		 705 aa  92.8  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 		 378 aa  92.8  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 		 306 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  24.74 
 
 		 297 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 342 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  24.74 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  32.66 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 		 310 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 		 691 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 312 aa  85.9  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1249  glycosyl transferase  31.36 
 
 		 275 aa  85.9  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  34.62 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 691 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2412  glycosyl transferase family 2  23.62 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 691 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1219  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.428258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 624 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  29.78 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.03 
 
 		 2401 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 1739 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 892 aa  82.8  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 705 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>