More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0688 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.32 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 		 275 aa  199  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2412  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0854  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2292  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0884  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0405  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3153  putative glycosyl transferase WbiF  32.46 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3093  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.46 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3130  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.09 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1979  glycosyl transferase, putative  32.09 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0934  putative glycosyl transferase  32.09 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3981  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.653687 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1841  putative glycosyl transferase  32.08 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2764  putative glycosyl transferase  32.08 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266345  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3783  putative glycosyl transferase  33.58 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193326  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2722  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2507  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1480  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  31.72 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0899  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 		 324 aa  99.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 298 aa  98.6  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 318 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  30.67 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  30.15 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 329 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 		 360 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 306 aa  92  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 317 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 305 aa  89.7  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 318 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 		 325 aa  89  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  32.7 
 
 		 288 aa  89  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 333 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 324 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 		 340 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0348  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 244 aa  86.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02870  hypothetical protein  26.07 
 
 		 286 aa  85.5  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 		 327 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2632  glycosyltransferases-like  32.2 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.39 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  21.85 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1629  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3458  glycosyltransferases-like protein  24.26 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0190923  normal  0.0113746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  25.1 
 
 		 652 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0724  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837164  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 313 aa  78.6  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  29.74 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>