206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1629 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1629  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 342 aa  678    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2055  putative glycosyltransferase  64.67 
 
 		 346 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155199  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  32.66 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0854  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0884  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0405  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  27.78 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.43 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 691 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 314 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 287 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2507  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  22.69 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.02 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  31.06 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 683 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  25 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 824 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3783  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193326  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  26.78 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  32.23 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2292  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  28.2 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 841 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  37.31 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  23.23 
 
 		 277 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3981  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.653687 
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.96 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  27.96 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  22.18 
 
 		 652 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  21.89 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 1340 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  28.93 
 
 		 1837 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1480  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  28.7 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 		 892 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  22.73 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1298  glycosyltransferases-like  28.99 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 836 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  22.5 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  31.18 
 
 		 288 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 		 1075 aa  53.1  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  21.69 
 
 		 327 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  28.57 
 
 		 279 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02870  hypothetical protein  22.31 
 
 		 286 aa  52.8  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 		 282 aa  52.8  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  20.89 
 
 		 275 aa  52.8  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 995 aa  52.8  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  22.51 
 
 		 703 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>