132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2055 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2055  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 346 aa  688    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155199  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1629  glycosyl transferase family protein  64.67 
 
 		 342 aa  411  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  28.68 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  29.7 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  23.05 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 691 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0884  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0854  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0405  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 268 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1480  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  27.85 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  30.45 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 691 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4275  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000150665  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3153  putative glycosyl transferase WbiF  27.57 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  26.92 
 
 		 1837 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3130  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.21 
 
 		 276 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2507  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 221 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  35.66 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.88 
 
 		 322 aa  53.1  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0934  putative glycosyl transferase  27.57 
 
 		 318 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3093  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.57 
 
 		 276 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 691 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1979  glycosyl transferase, putative  27.57 
 
 		 276 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.43 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2764  putative glycosyl transferase  27.57 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1841  putative glycosyl transferase  27.57 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  22.82 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2292  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.56 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 824 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.41 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3783  putative glycosyl transferase  25.36 
 
 		 281 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193326  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3981  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.653687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  23.23 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2298  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200708  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  21.88 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  21.31 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 		 282 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 		 314 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2327  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.44 
 
 		 247 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 		 324 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 303 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 		 683 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 		 334 aa  46.6  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 312 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 995 aa  46.2  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 		 308 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 		 286 aa  46.2  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  28.31 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 		 616 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  36.36 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  40.68 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0786  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460061  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 		 822 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>