283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0786 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0786  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
345 aa  693    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460061  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3947  glycosyltransferases-like  88.32 
 
 
303 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0566  glycosyltransferase-like  54.2 
 
 
327 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418965  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3190  glycosyl transferase family 2  49.83 
 
 
314 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.035048  hitchhiker  0.000201325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0372  glycosyl transferase family 2  42.96 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
282 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
299 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
314 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
324 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  23.4 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  27.38 
 
 
652 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  23.44 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.85 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.44 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  22.34 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
387 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  25.09 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.4 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.35 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 
705 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  24.33 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
836 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2391  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.337746  normal  0.474802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.97 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  22.71 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  30.95 
 
 
642 aa  70.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
841 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4275  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000150665  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.79 
 
 
838 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
319 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  28.07 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
1435 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  27.38 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0771  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 
287 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
334 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
658 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  26.1 
 
 
307 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
327 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
290 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  26.69 
 
 
348 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
841 aa  62.8  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>