183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0372 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0372  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
317 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0566  glycosyltransferase-like  53.85 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418965  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3947  glycosyltransferases-like  42.95 
 
 
303 aa  242  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0786  glycosyl transferase family protein  42.96 
 
 
345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460061  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3190  glycosyl transferase family 2  41.81 
 
 
314 aa  219  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.035048  hitchhiker  0.000201325 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.07 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  20.7 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  29.47 
 
 
838 aa  65.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  22.65 
 
 
324 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.45 
 
 
355 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
307 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 
324 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
336 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 
334 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
324 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  28.06 
 
 
279 aa  62.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
319 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  24.33 
 
 
907 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  23.21 
 
 
652 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  28.11 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  29.6 
 
 
884 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
714 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2942  glycosyltransferase-like protein  25 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
822 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
282 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
288 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
310 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 
318 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  22.03 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  21.5 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  22.81 
 
 
360 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  23.86 
 
 
705 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 
841 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  22.03 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.05 
 
 
379 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
291 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  23.04 
 
 
358 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
334 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
343 aa  56.2  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
387 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 
836 aa  55.8  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
340 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0884  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
281 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  22.54 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8508  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  0.0306024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
841 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  29.25 
 
 
613 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  29.25 
 
 
623 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  29.25 
 
 
613 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.25 
 
 
613 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3131  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.25 
 
 
613 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  29.25 
 
 
613 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  21.64 
 
 
296 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  23.71 
 
 
274 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0746  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
951 aa  53.9  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.38831  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
290 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
353 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
306 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2391  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 
282 aa  52.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.337746  normal  0.474802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
306 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  22.95 
 
 
336 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 
315 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4275  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
271 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000150665  normal  0.321914 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>