255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3947 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3947  glycosyltransferases-like  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0786  glycosyl transferase family protein  88.32 
 
 		 345 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460061  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0566  glycosyltransferase-like  56.99 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3190  glycosyl transferase family 2  49.82 
 
 		 314 aa  285  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.035048  hitchhiker  0.000201325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0372  glycosyl transferase family 2  42.95 
 
 		 317 aa  242  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 282 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  23.51 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  25.2 
 
 		 652 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  21.67 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  27.06 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  21.82 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 		 705 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  20.51 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.43 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  25.64 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 		 836 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.38 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  21.65 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 		 387 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  22.89 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  29.44 
 
 		 838 aa  65.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  27.47 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4275  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000150665  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 		 841 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  22.48 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 841 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  24.79 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  22.48 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  22.48 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2391  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.337746  normal  0.474802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.22 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  25.53 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  25.36 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  24.42 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>