272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0566 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0566  glycosyltransferase-like  100 
 
 
327 aa  649    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418965  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3947  glycosyltransferases-like  56.99 
 
 
303 aa  328  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0786  glycosyl transferase family protein  54.2 
 
 
345 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460061  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0372  glycosyl transferase family 2  53.85 
 
 
317 aa  308  9e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3190  glycosyl transferase family 2  50.34 
 
 
314 aa  271  9e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.035048  hitchhiker  0.000201325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
324 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
304 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
298 aa  99.8  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.32 
 
 
311 aa  99.4  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
282 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  23.32 
 
 
297 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
312 aa  86.7  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  22.92 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  23.24 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.25 
 
 
838 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  27.94 
 
 
284 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 
324 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
705 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  23.57 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  27.06 
 
 
907 aa  72.8  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  31.58 
 
 
279 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.8 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2942  glycosyltransferase-like protein  29.72 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
836 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  22.57 
 
 
652 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
658 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.35 
 
 
283 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  22.06 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
841 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
656 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  19.73 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.49 
 
 
1119 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  28 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
822 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  26.24 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
334 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>