More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0060 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  56.52 
 
 		 658 aa  659    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 656 aa  1298    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 		 382 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 		 310 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 398 aa  94  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 424 aa  94  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 		 750 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 317 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 		 705 aa  87  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.16 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  33.71 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 1264 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  31.93 
 
 		 907 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  27.55 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 294 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  28.8 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 362 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 1314 aa  82.4  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.57 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  30.43 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.94 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.21 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.21 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  31.21 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  31.21 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  31.21 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.21 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 361 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 371 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 299 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 		 739 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 1287 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.06 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  40.43 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 		 1312 aa  78.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 705 aa  78.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  34.57 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  37.59 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.57 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 679 aa  77.4  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0566  glycosyltransferase-like  31.6 
 
 		 327 aa  76.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 372 aa  76.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 312 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 303 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 		 365 aa  77  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 		 704 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 		 465 aa  76.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  39.26 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  27.72 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  24.65 
 
 		 652 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 689 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.13 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  26.79 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  31.21 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>