More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1068 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 658 aa  1319    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  56.68 
 
 		 656 aa  667    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 		 282 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 		 372 aa  97.1  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 374 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 750 aa  92.8  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.63 
 
 		 407 aa  90.5  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 424 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 385 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 424 aa  88.2  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 399 aa  87.4  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  38.97 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 689 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.01 
 
 		 381 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.26 
 
 		 370 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.14 
 
 		 365 aa  83.2  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  38.06 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.71 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.22 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.16 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.22 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 705 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.22 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.22 
 
 		 381 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  27.22 
 
 		 381 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  27.22 
 
 		 381 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  24.68 
 
 		 297 aa  80.1  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  29.03 
 
 		 907 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  27.22 
 
 		 381 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 		 406 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 325 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 414 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 373 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 		 398 aa  80.1  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 		 407 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.22 
 
 		 381 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 311 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 329 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.17 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  23 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.33 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  26.41 
 
 		 297 aa  77  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 397 aa  77  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 		 377 aa  77  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 		 388 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 396 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 350 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 380 aa  77  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  21.13 
 
 		 350 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 739 aa  76.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  22.5 
 
 		 381 aa  77  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 344 aa  76.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 		 970 aa  76.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.68 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 660 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  28.99 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  37.12 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 		 365 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>