More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1498 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
373 aa  762    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
369 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
403 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0056  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.368795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
389 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
379 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
394 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
381 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
378 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
385 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.72 
 
 
365 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  28.62 
 
 
365 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.69 
 
 
371 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
395 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
395 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
399 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 
387 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
390 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
360 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
373 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.1 
 
 
419 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
389 aa  106  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
390 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
446 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
390 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
384 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
373 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
387 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
391 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
385 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
388 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
371 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
392 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
398 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
395 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  27.62 
 
 
383 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
370 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
363 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
387 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.29 
 
 
388 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
377 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
399 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
371 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
382 aa  99.8  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
381 aa  99.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
392 aa  99.4  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
389 aa  99.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
379 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
374 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.47 
 
 
400 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
372 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.23 
 
 
411 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  22.95 
 
 
391 aa  96.7  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
364 aa  97.1  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
380 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  23.72 
 
 
393 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.82 
 
 
359 aa  96.3  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
377 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6051  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.34 
 
 
378 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
378 aa  95.9  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  26.88 
 
 
384 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  26.03 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  35.98 
 
 
440 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
439 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
413 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
382 aa  93.6  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.9 
 
 
381 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
391 aa  92.8  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
381 aa  92.8  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
396 aa  92.8  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  27.24 
 
 
372 aa  92.8  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
370 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>