More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0171 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
419 aa  827    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  56.9 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  51.71 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  35.54 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.54 
 
 
366 aa  173  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
396 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
364 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
350 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
374 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  25.96 
 
 
347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 
398 aa  117  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  29.12 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  26.65 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
414 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
409 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
388 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 
398 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 
390 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
353 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  43.79 
 
 
370 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  25.08 
 
 
321 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 
378 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  28.35 
 
 
369 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
392 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
371 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  27.11 
 
 
358 aa  104  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  39.64 
 
 
371 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
396 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 
388 aa  103  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  38.98 
 
 
392 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.45 
 
 
379 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  36.09 
 
 
440 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
353 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
370 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  38.03 
 
 
353 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
384 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
375 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
404 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
396 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
364 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.65 
 
 
372 aa  100  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  44.68 
 
 
379 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.38 
 
 
396 aa  100  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  39.87 
 
 
386 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.73 
 
 
374 aa  99.8  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
890 aa  99.8  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 
394 aa  99  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
368 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
1080 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  33.86 
 
 
375 aa  97.1  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
366 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 
426 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
365 aa  96.7  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  38.87 
 
 
372 aa  96.3  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  43.94 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  33.77 
 
 
346 aa  95.5  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  37.64 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
443 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  31.4 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13941  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
363 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164245  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
381 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  32.42 
 
 
385 aa  94.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
394 aa  94.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
372 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  24.13 
 
 
359 aa  94  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
383 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.57 
 
 
369 aa  94  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
803 aa  94  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
348 aa  93.6  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
426 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
361 aa  93.2  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
420 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
374 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  23.78 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  42.07 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  31.98 
 
 
340 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
414 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
382 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  35.71 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
394 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  39.22 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
394 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
384 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
394 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>