More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1090 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 375 aa  770    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  49.31 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  48.12 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  39.26 
 
 		 375 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  37.19 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  34.68 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 		 348 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 371 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 374 aa  149  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  31.25 
 
 		 393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 368 aa  123  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.62 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2494  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  43.54 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  28.39 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  42.28 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  41.46 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  40.29 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.87 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.87 
 
 		 386 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  44.03 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 398 aa  99.8  7e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 		 356 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 356 aa  99.4  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  42.36 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  26.12 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.12 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  39.73 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 356 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  25.58 
 
 		 358 aa  96.3  7e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  25.92 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  26.16 
 
 		 347 aa  93.2  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 392 aa  92.8  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  34.57 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.7 
 
 		 415 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  26.26 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 401 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  29.13 
 
 		 366 aa  89.7  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.23 
 
 		 374 aa  89.7  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  27.04 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.32 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  27.03 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  28.37 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  35.63 
 
 		 890 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  41.01 
 
 		 394 aa  87.4  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 		 383 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 374 aa  86.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.17 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  43.36 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>