More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2494 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2494  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 374 aa  722    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  35.31 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 		 309 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  31.78 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  46.21 
 
 		 374 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  37.01 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  40.41 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  35.92 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.17 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.92 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  38.85 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.91 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  39.07 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.32 
 
 		 465 aa  82.8  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  40.97 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  40.17 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  45.74 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  38.26 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  38.13 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  39.55 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  38.93 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  38.22 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  36.88 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.42 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  35 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  35.76 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  35 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  31.66 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.55 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.35 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.55 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.55 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  34 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.55 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  38.35 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.44 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.86 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  42.06 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  41.67 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3395  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 399 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  38.56 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.44 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  41.48 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3566  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  40.72 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.45 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>