More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1815 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 381 aa  758    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 		 375 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 365 aa  123  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  29.03 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 360 aa  99.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  41.22 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 361 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 660 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  25.15 
 
 		 366 aa  96.3  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.15 
 
 		 366 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 348 aa  96.3  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 393 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  38.17 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  39.76 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.56 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.06 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 386 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  29.55 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  39.86 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 		 808 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  32.91 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 387 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  35.33 
 
 		 385 aa  86.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 395 aa  86.3  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 1264 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  27.01 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  30.98 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  37.67 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2494  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  41.61 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.32 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 669 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 		 890 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  36.17 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  20.58 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.27 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  24.26 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13941  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  40.28 
 
 		 750 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  39.71 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  26.5 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>