More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2493 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 353 aa  701    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  36.1 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  36.09 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 374 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13941  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 363 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 		 424 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.27 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  38.86 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  25.99 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  35.19 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 660 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  22.42 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  33.97 
 
 		 416 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 669 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 890 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 762 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  26.91 
 
 		 347 aa  106  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 678 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  40.4 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  38.05 
 
 		 443 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 		 808 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.15 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 		 368 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  26.09 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 435 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 381 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  33.17 
 
 		 365 aa  96.7  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  33.17 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  35.37 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1209  putative glycosyltransferase  34.16 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  25.34 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  25.42 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 		 357 aa  93.2  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 414 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  22.26 
 
 		 347 aa  92.8  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  37.08 
 
 		 346 aa  92.4  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  38.86 
 
 		 399 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 		 401 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  24.75 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2090  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  24.63 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 398 aa  89.7  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 378 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 		 404 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 		 395 aa  89.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  27.36 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 		 384 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  34.84 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 375 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 		 399 aa  87.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.27 
 
 		 352 aa  86.7  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 1264 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.89 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.89 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  28.89 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  28.89 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.89 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  28.89 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  24.83 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0297  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  37.71 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.19 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  28.85 
 
 		 513 aa  82.8  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1492  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>