More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13013 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  100 
 
 
321 aa  630  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  30.53 
 
 
374 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  29.75 
 
 
366 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 
373 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.55 
 
 
372 aa  127  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  34.3 
 
 
379 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
346 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.88 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  28.34 
 
 
365 aa  119  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.88 
 
 
365 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  27.56 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  36.23 
 
 
376 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
419 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
371 aa  105  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
398 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 
365 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
376 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
390 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 
425 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
348 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  22.12 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
399 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  29.07 
 
 
393 aa  94  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  30.59 
 
 
369 aa  93.2  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  28.2 
 
 
374 aa  92.8  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
370 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
370 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.67 
 
 
380 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00449508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  26.92 
 
 
419 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  27.13 
 
 
440 aa  89  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 
353 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
391 aa  87  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 
384 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.54 
 
 
386 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
409 aa  85.9  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.16 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
367 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.51 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
370 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0077  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
359 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  31.31 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.07 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.07 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
414 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  38.02 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  22.4 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
812 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
370 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
762 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.39 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2021  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.83 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
362 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.39 
 
 
392 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.05 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  26.22 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  27.24 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.63 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.63 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.63 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.63 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  22.87 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  31.97 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>