More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0370 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 401 aa  796    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  35.81 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  41.3 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 		 419 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  44.3 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.48 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  38.12 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.21 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 346 aa  94.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 364 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 		 361 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 		 375 aa  90.5  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 		 370 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  31.09 
 
 		 399 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  29.04 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 		 365 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  37.09 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 377 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 373 aa  86.3  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 360 aa  86.3  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.16 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.16 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.86 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.16 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.16 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.16 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.16 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  33.13 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.3 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.8 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.81 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  27.59 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.61 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  22.07 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  32.87 
 
 		 638 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  38.13 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  34.13 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  24.36 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  28.83 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 1032 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.58 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>