More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3477 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
418 aa  850    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
396 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.17 
 
 
415 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
375 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.93 
 
 
392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.52 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  37.07 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.69 
 
 
392 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  30.68 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.29 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
419 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
393 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
399 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
365 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  27.16 
 
 
419 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
348 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
346 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  29.28 
 
 
357 aa  101  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 
374 aa  100  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.54 
 
 
419 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
371 aa  99  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
388 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  41.48 
 
 
368 aa  97.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
366 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
375 aa  96.7  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  38.52 
 
 
375 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
401 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.65 
 
 
396 aa  94.4  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
380 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
385 aa  93.6  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
413 aa  93.2  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  29.02 
 
 
440 aa  93.2  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
363 aa  92.8  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  37.33 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
387 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.89 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  24.44 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  32.56 
 
 
346 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
359 aa  90.9  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
379 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
309 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
381 aa  89.7  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
364 aa  89.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.68 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.06 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  39.31 
 
 
384 aa  89  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.14 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2336  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
806 aa  89  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
393 aa  88.2  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
380 aa  87.4  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
346 aa  86.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
364 aa  86.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
368 aa  86.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
399 aa  86.3  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  29.48 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  41.8 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.4 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
820 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  36.23 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
392 aa  84  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.6 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
871 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  23.79 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>