More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02469 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  100 
 
 
379 aa  764    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
376 aa  209  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  32.08 
 
 
365 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  32.09 
 
 
366 aa  155  8e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  31.81 
 
 
365 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
371 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  31.71 
 
 
365 aa  153  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 
375 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 
376 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.72 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.56 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
365 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.39 
 
 
374 aa  134  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
365 aa  132  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.23 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  33.12 
 
 
369 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
393 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
374 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
348 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  34.3 
 
 
321 aa  124  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
363 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
346 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  27.72 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.35 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  37.8 
 
 
359 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  29.37 
 
 
393 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
356 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.14 
 
 
415 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
384 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
375 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.47 
 
 
365 aa  109  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.69 
 
 
498 aa  109  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
364 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
361 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
368 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
361 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 
359 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
364 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
368 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
386 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
356 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
356 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
356 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
360 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.86 
 
 
465 aa  103  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
419 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.08 
 
 
420 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
396 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.08 
 
 
420 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.08 
 
 
420 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
374 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.08 
 
 
392 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
356 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
356 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.38 
 
 
356 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
356 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 
420 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.36 
 
 
392 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 
420 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
361 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
361 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.23 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  27.56 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
309 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
346 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  26.7 
 
 
358 aa  97.1  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
361 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
360 aa  97.1  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
361 aa  96.7  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 
370 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  29.18 
 
 
357 aa  96.3  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
358 aa  95.9  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
361 aa  94  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
419 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
361 aa  93.6  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
409 aa  93.2  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  28.29 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
359 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.29 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
425 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
364 aa  89.7  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  31.52 
 
 
419 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
374 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>