More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0778 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
393 aa  798    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  43.38 
 
 
375 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 
390 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 
371 aa  202  9e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
365 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  34.05 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  38.81 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  35.67 
 
 
346 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
361 aa  162  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
376 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
368 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
375 aa  144  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
386 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 
364 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  28.46 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  32.12 
 
 
379 aa  129  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
309 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  28.76 
 
 
365 aa  123  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  29.03 
 
 
365 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  28.49 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
396 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  33.84 
 
 
379 aa  121  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 
403 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
370 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.14 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  25.81 
 
 
354 aa  113  6e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  27.3 
 
 
358 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  42.07 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.95 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
390 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 
359 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
386 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.27 
 
 
373 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  37.73 
 
 
420 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 
368 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 
419 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
384 aa  107  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.27 
 
 
372 aa  105  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.42 
 
 
365 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
363 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
364 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
388 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  35.12 
 
 
364 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
401 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
368 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.17 
 
 
396 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.84 
 
 
415 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
365 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  26.41 
 
 
374 aa  100  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1616  glycosyl transferase, group 1  22.66 
 
 
358 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
388 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
364 aa  99.8  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
419 aa  97.8  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  44.29 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
393 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.35 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0191  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
364 aa  97.4  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  36.16 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
404 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  38.98 
 
 
388 aa  96.7  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
373 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
393 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.08 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.08 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
418 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.08 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0187  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.08 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.08 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.08 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.08 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
381 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
361 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
359 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  25.89 
 
 
359 aa  93.2  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
355 aa  93.2  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  34.64 
 
 
346 aa  92.8  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
380 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  25.61 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
361 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  35.8 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
361 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  36.62 
 
 
425 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  27.67 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>