More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1089 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 363 aa  749    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  40.06 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  36.44 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.36 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.36 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.36 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.36 
 
 		 420 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.36 
 
 		 420 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.16 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.36 
 
 		 420 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.36 
 
 		 420 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  28.77 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  27.42 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 		 396 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  36.87 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  38.04 
 
 		 419 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  30.38 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 403 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.22 
 
 		 396 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 		 443 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 359 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  39.07 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.78 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 361 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.42 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  30.72 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.95 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 386 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 409 aa  95.9  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 		 364 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 364 aa  94  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  34.52 
 
 		 357 aa  93.2  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 		 356 aa  93.2  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 418 aa  92.8  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 361 aa  92.8  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.84 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  34.11 
 
 		 399 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  38.13 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  30.17 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 762 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 425 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  27.05 
 
 		 416 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 		 1032 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>