More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1592 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 346 aa  695    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 399 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 		 375 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.78 
 
 		 373 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  30.62 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  30.62 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  30.62 
 
 		 365 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  28.85 
 
 		 369 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  29.8 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.3 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  27.61 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.01 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.72 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.85 
 
 		 377 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 364 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.06 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 856 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 376 aa  96.3  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 420 aa  96.3  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  39.09 
 
 		 370 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 401 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  26.15 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.15 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 379 aa  92.4  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 		 391 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  38.65 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 366 aa  89.7  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 		 370 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 739 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.62 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  30.43 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 418 aa  86.7  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.88 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 309 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  33.17 
 
 		 357 aa  85.9  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  27.69 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  29.17 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3395  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.46 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00449508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  28.5 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.35 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3394  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.65 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.65 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.65 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.65 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.65 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.65 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.65 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  22.65 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 750 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 		 1032 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.35 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  39.66 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3396  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.84 
 
 		 498 aa  79.3  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.48 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.78 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  28.16 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>