More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1475 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  100 
 
 
357 aa  725    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  51.68 
 
 
360 aa  393  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  49.01 
 
 
363 aa  350  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  45.92 
 
 
364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  44.96 
 
 
360 aa  317  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  45.45 
 
 
361 aa  314  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  42.94 
 
 
359 aa  288  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  44.03 
 
 
350 aa  286  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
364 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.16 
 
 
346 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
386 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
370 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
390 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  32.73 
 
 
365 aa  102  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
355 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
418 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
376 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  32.27 
 
 
365 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
414 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  30.91 
 
 
366 aa  99.8  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  32.27 
 
 
365 aa  99.4  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
387 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  33.65 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
377 aa  96.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
393 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.18 
 
 
379 aa  95.9  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.17 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
390 aa  94.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  22.97 
 
 
361 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
373 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 
363 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 
399 aa  93.6  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
387 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
396 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
309 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
389 aa  93.2  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
367 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  27.75 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.41 
 
 
745 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
374 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.07 
 
 
396 aa  90.1  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.16 
 
 
373 aa  90.5  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
358 aa  89.7  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
420 aa  89.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
355 aa  89.7  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 
393 aa  89.4  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
401 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
417 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
425 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
386 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 
351 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 
368 aa  87.4  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
380 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
378 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
383 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
352 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
419 aa  86.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
412 aa  86.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
375 aa  86.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
366 aa  86.3  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
398 aa  85.9  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
371 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  34.42 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
392 aa  84  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3017  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  29.27 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  26.5 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>