More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2021 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2021  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 388 aa  796    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2253  glycosyl transferase group 1  40.15 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4707  glycosyl transferase group 1  30.02 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.103608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 		 367 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  32.77 
 
 		 321 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  37.39 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.21 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  38.05 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  32.7 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02227  hypothetical protein  30.77 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.49 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  28.22 
 
 		 347 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  30.92 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  30.81 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.21 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0316  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.451798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1492  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  30.33 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.84 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  37.4 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.05 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 689 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  39.77 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  33.81 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2684  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  24.49 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 656 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  35.61 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.2 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  31.72 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1388  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.980179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>