More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4707 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4707  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 378 aa  783    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.103608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2253  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2021  glycosyl transferase group 1  30.02 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  28.19 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  28.15 
 
 		 598 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  35.17 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  34.23 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  32.83 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  30.81 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 704 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.7 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  38.53 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  39.6 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  23.2 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 394 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  34.43 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 424 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 762 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  34.56 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  29.19 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  41.77 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  44.16 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  29.89 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1608  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.872915 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2365  glycosyl transferase, group 1  34.67 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0471008  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  32.2 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  27.23 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  36.89 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  32.14 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  29.5 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.87 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  30.91 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  35.24 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  39.24 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.81 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  28.06 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  29.85 
 
 		 490 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  29.85 
 
 		 490 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  36.89 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  25.26 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>