More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02227 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02227  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  736    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  60.73 
 
 
356 aa  441  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0305  putative glycosyl transferase  43.2 
 
 
329 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  30.08 
 
 
395 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
374 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.1 
 
 
373 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25 
 
 
371 aa  90.5  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
394 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
380 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  31.82 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.83 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  26.86 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
536 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  34.21 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.92 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
750 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  32.52 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.61 
 
 
745 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  26.45 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  31.87 
 
 
382 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  35.54 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  35.54 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  35.54 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1097  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.372916  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  36.28 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.51 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  35.25 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  38.28 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  30.9 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.52 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  22.75 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
388 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
351 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
389 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  28.81 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  36.64 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.55 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
383 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  23.94 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  31.76 
 
 
382 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
656 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  25.53 
 
 
403 aa  67  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  31.21 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
439 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
739 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  31.08 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  35.14 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2021  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  30.25 
 
 
513 aa  66.2  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>