More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1492 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1492  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 373 aa  775    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  26.45 
 
 		 745 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.31 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  23.51 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 396 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 		 398 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.34 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  22.61 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.92 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  23.94 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27.53 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  20.38 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  29.12 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  21.78 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  27.12 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3431  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  27.68 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  36.97 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.69 
 
 		 745 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.97 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 413 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.48 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 689 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 		 355 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  21.62 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 669 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  23.42 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  25.82 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  26.2 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  21.67 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.07 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  31.21 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>