More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0172 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
374 aa  751    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  55.04 
 
 
381 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  57.07 
 
 
377 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
373 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
904 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  35.49 
 
 
377 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
378 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  35.31 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
394 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
359 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.53 
 
 
406 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.53 
 
 
406 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.53 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.92 
 
 
406 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  31.62 
 
 
406 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  31.62 
 
 
406 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  32.92 
 
 
406 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.13 
 
 
406 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
406 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  32.92 
 
 
406 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
406 aa  106  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
410 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
366 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  32.78 
 
 
406 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.33 
 
 
406 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
395 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
406 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
374 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  30.77 
 
 
419 aa  97.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
369 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
385 aa  94  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
417 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
360 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
410 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
391 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
409 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.64 
 
 
365 aa  90.9  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
416 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
414 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
409 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
404 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.29 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 
440 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
454 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.53 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  40.85 
 
 
770 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.84 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  39.22 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
409 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
367 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  32.77 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
452 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  42 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
419 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  29.96 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  37.25 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  27.02 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.63 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  24.68 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1492  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>