More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2660 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 389 aa  777    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  84.8 
 
 		 378 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  81.18 
 
 		 380 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  73.21 
 
 		 377 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  72.68 
 
 		 377 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  75.8 
 
 		 384 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  70.43 
 
 		 377 aa  511  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  47.34 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  46.51 
 
 		 416 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  43.28 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  43.28 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  45.31 
 
 		 397 aa  275  8e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  45.6 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  41.11 
 
 		 387 aa  272  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  38.83 
 
 		 389 aa  255  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  38.34 
 
 		 389 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  42.68 
 
 		 375 aa  253  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  38.65 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 		 406 aa  219  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 376 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 415 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  30.47 
 
 		 419 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.15 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  26.15 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 378 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  26.15 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  26.15 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.15 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  25.97 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.76 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 		 373 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 365 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000129984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  39.29 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  41.24 
 
 		 822 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 364 aa  89.7  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 		 739 aa  89.4  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 371 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 750 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  22.54 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 394 aa  87  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  31.31 
 
 		 394 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 383 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.5 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 377 aa  86.3  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  25.8 
 
 		 395 aa  86.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  27.12 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  37.11 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  26.32 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.5 
 
 		 745 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  24.13 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.02 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.02 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.21 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>