More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1223 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  95.36 
 
 
389 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
389 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  62.67 
 
 
389 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  56.27 
 
 
378 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  50.95 
 
 
375 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  47.3 
 
 
387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
377 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  39.04 
 
 
377 aa  259  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  42.99 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  40.87 
 
 
377 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 
419 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 
419 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  40.99 
 
 
384 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 
397 aa  246  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  40.25 
 
 
380 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 
468 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  40.19 
 
 
389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  38.86 
 
 
399 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  39.34 
 
 
416 aa  226  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  39.31 
 
 
406 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
394 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
376 aa  106  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
358 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
400 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
377 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  26.41 
 
 
353 aa  93.2  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
369 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
407 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  35.71 
 
 
405 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.25 
 
 
356 aa  86.7  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  25.83 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  27.02 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  23.73 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  22.92 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  22.37 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
387 aa  77  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  25.24 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  38.85 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 
689 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.82 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  23.02 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.56 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  21.17 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.84 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
1080 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54068  n-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  22.94 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15052  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
704 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.2 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  27.99 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  28.44 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  22.9 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.13 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
739 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 
743 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>