More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5115 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 353 aa  722    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  31.68 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 355 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  28.97 
 
 		 371 aa  136  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 377 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 385 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 375 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  26.9 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  27.69 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.85 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  34 
 
 		 739 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  27.3 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05199  glycosyltransferase  22.84 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 750 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1311  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1328  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  26.23 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3252  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1347  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.88 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.65 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  22.97 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 800 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  26.01 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  24.13 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.45 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 		 419 aa  69.3  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 748 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2884  a-glycosyltransferase  25.46 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0290347  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  21.98 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  27.35 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3788  glycosyltransferase  26.32 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>