More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3788 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3788  glycosyltransferase  100 
 
 		 349 aa  713    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0795  glycosyl transferase group 1  52.87 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  46.44 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2684  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  28.38 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  25.61 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.71 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  28.34 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  38.14 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  40.54 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  30.51 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  38.32 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 739 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3682  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0312  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  39.67 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.41 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  30.63 
 
 		 1147 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 750 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  34.04 
 
 		 488 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  35.29 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  31.58 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 689 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0299  starch synthase  35.34 
 
 		 523 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  37.8 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  24.49 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.52 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0539  starch synthase  35.4 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0797  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1380  starch synthase  35.4 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0651235  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.12 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1775  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.57 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  35.86 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  31.4 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  32.76 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  26.09 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  28.28 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2176  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000383211  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.41 
 
 		 491 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30.43 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  26.51 
 
 		 484 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  39.64 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.33 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  27.18 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  31.41 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.67 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0792  starch synthase  30.11 
 
 		 553 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6051  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.25 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  33.85 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1085  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0750  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>