More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0795 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0795  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 354 aa  720    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3788  glycosyltransferase  52.87 
 
 		 349 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  44.79 
 
 		 337 aa  292  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2684  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 739 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  31.37 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  36.7 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  36.7 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 750 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  38.68 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  40.57 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  36.23 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.34 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  35.2 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  41.12 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  40.19 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.67 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0312  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1965  Starch synthase  31.76 
 
 		 566 aa  63.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00319381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 		 415 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0797  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.31 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  31.75 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  29.3 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  37.61 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0299  starch synthase  34.23 
 
 		 523 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375402  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0539  starch synthase  35.14 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1380  starch synthase  33.33 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0651235  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  27.22 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  27.31 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  29.05 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4045  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  34.45 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3003  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.65 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  22.34 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  28.74 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 386 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 		 398 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2176  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000383211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1417  starch synthase  28.38 
 
 		 564 aa  56.2  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000275139  hitchhiker  0.0037483 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 536 aa  56.2  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 		 537 aa  56.2  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  32.46 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  29.86 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>