More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1965 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1965  Starch synthase  100 
 
 		 566 aa  1154    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00319381  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1417  starch synthase  53.79 
 
 		 564 aa  638    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000275139  hitchhiker  0.0037483 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0968  starch synthase  36.92 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1038  starch synthase  34.65 
 
 		 484 aa  315  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000142829 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1878  starch synthase  35.26 
 
 		 482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1308  starch synthase  35.14 
 
 		 482 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.483213  normal  0.910545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0792  starch synthase  29.31 
 
 		 553 aa  192  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.03 
 
 		 482 aa  103  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.25 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  21.99 
 
 		 478 aa  96.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.16 
 
 		 491 aa  95.1  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.38 
 
 		 480 aa  95.1  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 414 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.8 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  22.43 
 
 		 490 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.36 
 
 		 490 aa  91.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  21.96 
 
 		 476 aa  90.9  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.9 
 
 		 489 aa  90.9  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.05 
 
 		 498 aa  90.5  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 536 aa  90.5  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 426 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  22.68 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 413 aa  87.8  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  21.83 
 
 		 474 aa  88.2  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.78 
 
 		 483 aa  87.8  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  25.28 
 
 		 515 aa  87.4  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.42 
 
 		 481 aa  87.4  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.08 
 
 		 423 aa  87.4  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 390 aa  87.4  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1380  starch synthase  22.63 
 
 		 523 aa  87  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0651235  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0299  starch synthase  22.01 
 
 		 523 aa  86.7  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  22.5 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0609  glycogen synthase  23.63 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.9 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  24.27 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  22.08 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.36 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.36 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  38.96 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  22.7 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06741  glycogen synthase  23.31 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.537732  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.01 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2803  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.69 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0129152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0539  starch synthase  22.09 
 
 		 523 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.86 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  21.94 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0810  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.16 
 
 		 448 aa  83.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  21.76 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.4 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  22.69 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  22.69 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  23.11 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  23.8 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  23.65 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  22.47 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  35.95 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  23.33 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.65 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  30.36 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  24.21 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  22.82 
 
 		 501 aa  80.9  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.3 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  21.75 
 
 		 544 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  29.11 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  23.77 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  27.27 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 379 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  23.68 
 
 		 492 aa  80.1  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2742  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.55 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.341368  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  23.89 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.27 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06651  glycogen synthase  23.14 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.57 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  28.71 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0346  glycogen/starch synthase ADP-glucose type  23.89 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  20.82 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.8 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.18 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0007  glycosyl transferase group 1  21.31 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.482024  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  31.53 
 
 		 650 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.27 
 
 		 482 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.09 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.2 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.09 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>