More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1918 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
388 aa  735    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  86.6 
 
 
386 aa  627  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3003  glycosyl transferase group 1  53.74 
 
 
375 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  46.88 
 
 
365 aa  255  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2176  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
381 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000383211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3020  glycosyl transferase group 1  47.18 
 
 
360 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6051  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.02 
 
 
378 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3142  glycosyl transferase group 1  49.55 
 
 
363 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  0.711865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2006  group 1 glycosyl transferase  44.27 
 
 
411 aa  175  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.669637  normal  0.233825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  43.12 
 
 
964 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2350  glycosyl transferase group 1  41.87 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169241  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  38.38 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5412  glycosyl transferase group 1  38.44 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13720  glycosyltransferase  38.91 
 
 
351 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
389 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  41.28 
 
 
384 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
374 aa  96.3  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
373 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
391 aa  93.2  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  23.38 
 
 
366 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.38 
 
 
366 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.07 
 
 
369 aa  90.1  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  23.38 
 
 
366 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
372 aa  89.7  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.1 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  23.1 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
377 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  39.22 
 
 
368 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
376 aa  86.7  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
364 aa  86.7  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
413 aa  86.3  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  32.51 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.13 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  24.13 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  24.13 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  24.13 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.13 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  38.6 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.49 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.13 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.87 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.17 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  26.19 
 
 
745 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.35 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.75 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  33.61 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.17 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  38.56 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  21.23 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  37.06 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.86 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  35.63 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
304 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  24.5 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.96 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  28.72 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>