More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4490 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 398 aa  793    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  79.49 
 
 		 435 aa  651    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  58.7 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 		 394 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  35.7 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  34.44 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  36.62 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 		 393 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 		 391 aa  176  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 		 401 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 409 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  36.64 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 403 aa  136  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 376 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  24.17 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  31.8 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 		 452 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  31.05 
 
 		 413 aa  89.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  25.96 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  27.19 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  41.3 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5607  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.08 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.15 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2954  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  35.2 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0730  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00119132  hitchhiker  0.00102221 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  38.12 
 
 		 407 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.44 
 
 		 388 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 443 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0521  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.81 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.14 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2498  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.81 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0028  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.81 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0807  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.48 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.64262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2876  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.81 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2208  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.81 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0628  glycosyltransferase  27.81 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0643  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.48 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>