More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3003 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3003  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 375 aa  687    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  57.18 
 
 		 386 aa  318  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  55.47 
 
 		 388 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  51.23 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2176  glycosyl transferase group 1  55.73 
 
 		 381 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000383211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3020  glycosyl transferase group 1  48.07 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6051  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.22 
 
 		 378 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2006  group 1 glycosyl transferase  45.48 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.669637  normal  0.233825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  40.77 
 
 		 357 aa  188  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  45.74 
 
 		 964 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3142  glycosyl transferase group 1  49.24 
 
 		 363 aa  173  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  0.711865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5412  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 		 366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2350  glycosyl transferase group 1  43.68 
 
 		 359 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169241  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13720  glycosyltransferase  49.12 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.68 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  42.36 
 
 		 384 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  37.11 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  38.6 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 		 390 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 342 aa  96.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  41.95 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  30.36 
 
 		 379 aa  93.2  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  40.8 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  29.36 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  29.36 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  26.26 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  26.26 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  26.26 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.36 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.49 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 391 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.83 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  39.7 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  21.33 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  31.5 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  40.61 
 
 		 452 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.39 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  37.02 
 
 		 433 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  39.9 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  29.94 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 373 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.15 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 424 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 375 aa  87  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.41 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.65 
 
 		 365 aa  86.7  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  35.03 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 396 aa  86.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  20.95 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 373 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 379 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 421 aa  86.3  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 426 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.86 
 
 		 371 aa  86.3  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 396 aa  85.9  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 408 aa  86.3  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  29.08 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>