More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  100 
 
 		 964 aa  1780    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  53.62 
 
 		 557 aa  379  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  49.81 
 
 		 538 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  55.77 
 
 		 538 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  46.06 
 
 		 549 aa  310  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  54.2 
 
 		 357 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2350  glycosyl transferase group 1  56.22 
 
 		 359 aa  278  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169241  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1663  virulence factor MVIN family protein  50.86 
 
 		 541 aa  276  9e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.45805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  45.28 
 
 		 527 aa  271  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  42.14 
 
 		 588 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  41.79 
 
 		 648 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  48.71 
 
 		 552 aa  265  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  45.69 
 
 		 541 aa  258  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  49.86 
 
 		 365 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  44.2 
 
 		 539 aa  237  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  45.49 
 
 		 532 aa  229  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1908  virulence factor MVIN family protein  46.62 
 
 		 567 aa  224  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146225  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1917  virulence factor MVIN family protein  46.17 
 
 		 568 aa  222  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.731846  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3021  virulence factor MVIN family protein  41.75 
 
 		 540 aa  204  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2176  glycosyl transferase group 1  47.92 
 
 		 381 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000383211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6051  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.51 
 
 		 378 aa  197  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  43.39 
 
 		 386 aa  191  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  43.12 
 
 		 388 aa  185  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13720  glycosyltransferase  53.74 
 
 		 351 aa  179  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3020  glycosyl transferase group 1  44.84 
 
 		 360 aa  174  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3142  glycosyl transferase group 1  50.15 
 
 		 363 aa  174  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  0.711865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3003  glycosyl transferase group 1  45.48 
 
 		 375 aa  163  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2006  group 1 glycosyl transferase  42.9 
 
 		 411 aa  157  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.669637  normal  0.233825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5412  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 		 366 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  37.1 
 
 		 517 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  27.99 
 
 		 700 aa  119  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  31.94 
 
 		 674 aa  118  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  33.76 
 
 		 657 aa  115  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  31.29 
 
 		 534 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  27.65 
 
 		 1217 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 		 387 aa  111  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 376 aa  111  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  31.42 
 
 		 559 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  30.79 
 
 		 918 aa  108  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  32.82 
 
 		 535 aa  108  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  28.11 
 
 		 1219 aa  108  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  26.85 
 
 		 563 aa  107  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  28.53 
 
 		 544 aa  106  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  31.68 
 
 		 526 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 378 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  30.95 
 
 		 552 aa  99  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 		 533 aa  97.8  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  28.89 
 
 		 627 aa  97.8  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 373 aa  97.8  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  35.85 
 
 		 535 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 		 386 aa  96.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  28.92 
 
 		 621 aa  95.9  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 		 610 aa  95.1  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.31 
 
 		 365 aa  95.1  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 377 aa  95.1  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  31.13 
 
 		 570 aa  94.7  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  34.76 
 
 		 535 aa  93.6  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  29.26 
 
 		 532 aa  90.9  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 384 aa  90.1  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  26.47 
 
 		 521 aa  90.1  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  26.8 
 
 		 521 aa  89.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 		 580 aa  89.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  32.89 
 
 		 512 aa  88.6  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  27.39 
 
 		 1184 aa  89  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 390 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  27.37 
 
 		 1219 aa  87  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  28.85 
 
 		 552 aa  87  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 394 aa  87  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  30.71 
 
 		 560 aa  87  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  28.51 
 
 		 899 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  37.88 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 369 aa  84  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 		 379 aa  84.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 364 aa  84  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  28.3 
 
 		 568 aa  83.2  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 398 aa  83.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  28.51 
 
 		 569 aa  82.4  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 		 389 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  27.76 
 
 		 613 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  32.08 
 
 		 368 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  26.77 
 
 		 539 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  30.07 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  27.45 
 
 		 715 aa  78.2  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  25.89 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  26.87 
 
 		 1168 aa  77.8  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 		 390 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  27.87 
 
 		 708 aa  77  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  29.04 
 
 		 395 aa  77.4  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  27.89 
 
 		 521 aa  76.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  30.13 
 
 		 526 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  26.87 
 
 		 1263 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  26.87 
 
 		 1184 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>