More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4312 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  100 
 
 
521 aa  1025    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  41.01 
 
 
521 aa  366  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  39.87 
 
 
531 aa  309  9e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  36.07 
 
 
523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  33.27 
 
 
521 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  33.48 
 
 
522 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  39.05 
 
 
524 aa  277  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  34.81 
 
 
533 aa  263  8e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  35.62 
 
 
521 aa  262  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  35.09 
 
 
528 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  34.93 
 
 
514 aa  259  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  38.43 
 
 
526 aa  256  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  33.74 
 
 
521 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  29.9 
 
 
521 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  32.05 
 
 
525 aa  251  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  30.64 
 
 
549 aa  250  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  31.94 
 
 
522 aa  246  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  32.89 
 
 
522 aa  242  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  33.71 
 
 
521 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  32.5 
 
 
526 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 
534 aa  234  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  36.57 
 
 
514 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  31.03 
 
 
521 aa  233  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  33.71 
 
 
541 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  34.27 
 
 
495 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  35 
 
 
522 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  33.48 
 
 
613 aa  223  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  34.28 
 
 
518 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  33.54 
 
 
530 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  34.51 
 
 
535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  38.2 
 
 
556 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 
529 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  34.48 
 
 
535 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  35.21 
 
 
516 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  34.25 
 
 
535 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  32.3 
 
 
511 aa  217  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  30.69 
 
 
523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  31.38 
 
 
523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  31.51 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  34.2 
 
 
512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 
511 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  31.34 
 
 
511 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  32.73 
 
 
530 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  32.54 
 
 
512 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  32.3 
 
 
512 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  32.42 
 
 
530 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  31.82 
 
 
524 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  31.82 
 
 
524 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  31.82 
 
 
524 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  31.82 
 
 
524 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  31.82 
 
 
524 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  30.97 
 
 
519 aa  209  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  35.56 
 
 
533 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  29.52 
 
 
511 aa  209  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  33.78 
 
 
515 aa  208  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  32.46 
 
 
511 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  32.46 
 
 
511 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  32.46 
 
 
511 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  32.46 
 
 
511 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  32.46 
 
 
511 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  32.46 
 
 
511 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  31.92 
 
 
519 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  32.46 
 
 
511 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  32.46 
 
 
511 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  32.46 
 
 
511 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  32.07 
 
 
512 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  32.07 
 
 
512 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  33.92 
 
 
515 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  32.07 
 
 
522 aa  207  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  32.05 
 
 
517 aa  206  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  32.76 
 
 
519 aa  206  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  33.49 
 
 
512 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  32.33 
 
 
518 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  30.18 
 
 
511 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  30.18 
 
 
542 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  30.18 
 
 
511 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  27.42 
 
 
539 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  32.11 
 
 
519 aa  203  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  31.83 
 
 
520 aa  203  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  32.59 
 
 
517 aa  203  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  32.59 
 
 
517 aa  203  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  31.57 
 
 
511 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  32.81 
 
 
521 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  31.26 
 
 
528 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  32.55 
 
 
513 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  33.18 
 
 
522 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  30.4 
 
 
534 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  31.46 
 
 
521 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  29.58 
 
 
524 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  31.19 
 
 
508 aa  199  1.0000000000000001e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  31.13 
 
 
494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  31.07 
 
 
516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  31.22 
 
 
523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  29.5 
 
 
505 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1370  integral membrane protein MviN  31.35 
 
 
512 aa  197  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000411577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  27.67 
 
 
512 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  32.93 
 
 
511 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  33.25 
 
 
538 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  31.57 
 
 
548 aa  196  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  32.16 
 
 
525 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>